Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC1

Gm933, Predicted gene 933, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm933J3QPC1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms