Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gm2035J3QP87 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gm2035J3QP87 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Gm2035J3QP87 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Gm2035J3QP87 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Gm2035J3QP87 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm2035J3QP87 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Gm2035J3QP87 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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