Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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