Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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