Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3336J3QMQ6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3336J3QMQ6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3336J3QMQ6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3336J3QMQ6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3336J3QMQ6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3336J3QMQ6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3336J3QMQ6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3336J3QMQ6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3336J3QMQ6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3336J3QMQ6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3336J3QMQ6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3336J3QMQ6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3336J3QMQ6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3336J3QMQ6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3336J3QMQ6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3336J3QMQ6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3336J3QMQ6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3336J3QMQ6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3336J3QMQ6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3336J3QMQ6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3336J3QMQ6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3336J3QMQ6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3336J3QMQ6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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