Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms