Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tubgcp6G5E8P0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tubgcp6G5E8P0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Tubgcp6G5E8P0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tubgcp6G5E8P0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubgcp6G5E8P0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubgcp6G5E8P0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubgcp6G5E8P0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubgcp6G5E8P0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubgcp6G5E8P0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubgcp6G5E8P0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubgcp6G5E8P0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubgcp6G5E8P0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubgcp6G5E8P0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubgcp6G5E8P0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubgcp6G5E8P0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubgcp6G5E8P0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubgcp6G5E8P0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubgcp6G5E8P0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubgcp6G5E8P0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubgcp6G5E8P0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubgcp6G5E8P0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubgcp6G5E8P0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubgcp6G5E8P0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubgcp6G5E8P0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubgcp6G5E8P0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubgcp6G5E8P0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubgcp6G5E8P0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms