Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp17ldG5E8G2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp17ldG5E8G2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp17ldG5E8G2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp17ldG5E8G2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp17ldG5E8G2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp17ldG5E8G2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp17ldG5E8G2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp17ldG5E8G2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp17ldG5E8G2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp17ldG5E8G2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp17ldG5E8G2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp17ldG5E8G2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp17ldG5E8G2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp17ldG5E8G2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp17ldG5E8G2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp17ldG5E8G2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp17ldG5E8G2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp17ldG5E8G2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp17ldG5E8G2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp17ldG5E8G2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp17ldG5E8G2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp17ldG5E8G2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp17ldG5E8G2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp17ldG5E8G2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp17ldG5E8G2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp17ldG5E8G2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp17ldG5E8G2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp17ldG5E8G2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp17ldG5E8G2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp17ldG5E8G2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp17ldG5E8G2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp17ldG5E8G2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms