Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vmn1r67G5E8C1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r67G5E8C1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r67G5E8C1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r67G5E8C1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r67G5E8C1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r67G5E8C1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r67G5E8C1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r67G5E8C1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r67G5E8C1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r67G5E8C1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r67G5E8C1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r67G5E8C1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r67G5E8C1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r67G5E8C1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r67G5E8C1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r67G5E8C1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r67G5E8C1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r67G5E8C1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r67G5E8C1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms