Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms