Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms