Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
XntrpcF8VQM8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms