Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

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Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms