Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms