Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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H2-M1F7CXU4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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H2-M1F7CXU4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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H2-M1F7CXU4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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H2-M1F7CXU4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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H2-M1F7CXU4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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H2-M1F7CXU4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M1F7CXU4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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