Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Gm28038F7BCN9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Gm28038F7BCN9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm28038F7BCN9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
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Gm28038F7BCN9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Gm28038F7BCN9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Gm28038F7BCN9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Gm28038F7BCN9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Gm28038F7BCN9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Gm28038F7BCN9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Gm28038F7BCN9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Gm28038F7BCN9 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Gm28038F7BCN9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Gm28038F7BCN9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Gm28038F7BCN9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Gm28038F7BCN9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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