Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms