Protein–RNA interactions for Protein: F6VUT6

Gm8251, Predicted gene 8251, mousemouse

Predictions only

Length 1,994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8251F6VUT6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8251F6VUT6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8251F6VUT6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8251F6VUT6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8251F6VUT6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8251F6VUT6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms