Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syngap1F6SEU4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms