Protein–RNA interactions for Protein: F6QI24

Gm7945, Predicted gene 7945 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7945F6QI24 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms