Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms