Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pdzd7E9Q9W7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms