Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16f1E9Q9P8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms