Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

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Length 693 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TrdnE9Q9K5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TrdnE9Q9K5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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