Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Urb2E9Q7L1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Urb2E9Q7L1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Urb2E9Q7L1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Urb2E9Q7L1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Urb2E9Q7L1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Urb2E9Q7L1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Urb2E9Q7L1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Urb2E9Q7L1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Urb2E9Q7L1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Urb2E9Q7L1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Urb2E9Q7L1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Urb2E9Q7L1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Urb2E9Q7L1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Urb2E9Q7L1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Urb2E9Q7L1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Urb2E9Q7L1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Urb2E9Q7L1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Urb2E9Q7L1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Urb2E9Q7L1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Urb2E9Q7L1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Urb2E9Q7L1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Urb2E9Q7L1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Urb2E9Q7L1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms