Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Susd1E9Q3H4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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