Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
5430401F13RikE9Q328 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430401F13RikE9Q328 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms