Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Zfp558E9Q1J0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Zfp558E9Q1J0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Zfp558E9Q1J0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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Zfp558E9Q1J0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Zfp558E9Q1J0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Zfp558E9Q1J0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Zfp558E9Q1J0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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Zfp558E9Q1J0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Zfp558E9Q1J0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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