Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt78E9Q0F0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms