Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fndc1E9Q043 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms