Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx60E9PZQ1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ddx60E9PZQ1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ddx60E9PZQ1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ddx60E9PZQ1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Ddx60E9PZQ1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Ddx60E9PZQ1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ddx60E9PZQ1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ddx60E9PZQ1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ddx60E9PZQ1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx60E9PZQ1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx60E9PZQ1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx60E9PZQ1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx60E9PZQ1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx60E9PZQ1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx60E9PZQ1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx60E9PZQ1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx60E9PZQ1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx60E9PZQ1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx60E9PZQ1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx60E9PZQ1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx60E9PZQ1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx60E9PZQ1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx60E9PZQ1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx60E9PZQ1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx60E9PZQ1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx60E9PZQ1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx60E9PZQ1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx60E9PZQ1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx60E9PZQ1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms