Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ryr1E9PZQ0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms