Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scaf11E9PZM7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf11E9PZM7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms