Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rsph10bE9PYQ0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms