Protein–RNA interactions for Protein: E9PXX9

Slc28a1, Sodium/nucleoside cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a1E9PXX9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms