Protein–RNA interactions for Protein: E9PWQ3

Col6a3, Collagen, type VI, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 3,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a3E9PWQ3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a3E9PWQ3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a3E9PWQ3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms