Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc8E9PWG2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms