Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm3298E9PW80 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Gm3298E9PW80 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3298E9PW80 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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