Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms