Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl3E0CZ16 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 198.5 ms