Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms