Protein–RNA interactions for Protein: D3Z291

Calhm1, Calcium homeostasis modulator protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm1D3Z291 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Calhm1D3Z291 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms