Protein–RNA interactions for Protein: D3Z257

Gm5930, Predicted gene 5930, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5930D3Z257 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5930D3Z257 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms