Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ5

Tmed7, Transmembrane p24-trafficking protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed7D3YZZ5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed7D3YZZ5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed7D3YZZ5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms