Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc170D3YXL0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc170D3YXL0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms