Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Samd1D3YXK1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms