Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC048679D3YXE9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms