Protein–RNA interactions for Protein: D3YUU6

Crnn, Cornulin, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrnnD3YUU6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrnnD3YUU6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms