Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ube2d4D3YUH6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms