Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cttnbp2B9EJA2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms